水温尽可能与菇棚温度一致，不要用冰凉的水。原基、菇蕾上不要喷水，最好用喷雾器补水，喷嘴朝上向空间喷雾增湿。补水后，如菇体上有水珠应通风去除。
菌袋补水是重要的增产措施，主要用于栽培周期较长的食用菌。需注意：(1)香菇等转色完成、出菇前就要补水，补到培养料含水量65%左右。(2)多数食用菌在出完一、两潮菇后转潮期进行补水，要先养菌，再补水，补水量控制在原菌袋重量的80%-90%为好。(3)菌丝稀疏、长势弱、温度低于5℃或料内发生病虫害时不宜补水。(4)三潮菇后补水时，可同时补充营养物质，常用尿素、糖、磷酸二氢钾等。
