草菇链孢霉生长初期呈绒毛状，白色或灰色，生长后期呈粉红色、黄色。大量分生孢子堆集成团时，外观与猴头菌子实体相似，链孢霉主要以分生孢子传播为害，是高温季节发生的最重要杂菌。链孢霉菌丝顽强有力，有快速繁殖的特性，一旦大发生，便是灭顶之灾，其后果是菌种、培养袋或培养块成批报废。其防治方法有：
1、滴柴油 菌袋生产时，如果发现链孢霉，要在分生孢子团上滴上柴油，可防止链孢霉的扩散。
2、深埋 菌袋发菌后期受害，一般不要轻意报废，可将受害菌袋埋入深30－40厘米透气差的土壤中，经10－20天缺氧处理后，可有效减轻病害，菌袋仍可出菇。
3、注射 培养料感病以后，可采用5％的石碳酸、2％的甲醛、1:200倍的50％多菌灵、75％甲基托布津、ph值为10的石灰水注射，抑制链孢霉扩张。
