据南京中医药大学庄毅教授介绍，我国已报道食用药用真菌近1000种，有450余种真菌具有药效，单被正式列入药用的真菌有50多种，常用的有30多种，被明确纳入药典的有6种，分别为灵芝、云芝、茯苓、猪苓、雷丸和冬虫夏草。茯苓更是其中应用最多的一味。
由于真菌为异养型生物，且甲壳质的细胞壁不同于植物细胞，同时真菌内的酶和DNA也不同于植物，在20世纪初，拥有几十万物种的真菌从植物界分离出来，另建系统为真菌界。那么，以往归属于植物药内的“真菌类中药”也就失去了作为植物药的依据。在1998年，中国菌物学会药用真菌专业委员会与中国药学会药用真菌专业组通过了协商，并征求了全国70多位菌物与药物方面的高级专家得意见，最终联名向国家相关部门建议在中药范畴内正式冠名一类“菌物药”，用于区分植物药和动物药。
菌物药从何而来？
药物真菌和真菌药物是菌物药的两大分支。以真菌自身组织如子实体、菌核等入药者称药用真菌。药用真菌的来源靠野生采集或者人工培育生产，属于农业型生产。药用真菌大多属于较高等的真菌，其药用方式多种，单味应用或者配伍于复方汤剂、中成药。
真菌药物是指由固体发酵生产的真菌药物，是中药史上特有的、也是唯一的生物制药工程产品。早期的制作可统称为“制曲工艺”。神曲是中国最早的典型真菌药物，始产于北魏。自唐代沿用至今已逾1500年。李时珍曰：“古人用曲，多是造酒之曲，后医乃造神曲力更胜之。”20世纪60年代起，真菌药物进入固体培养时期。如用甘蔗渣等培养的猴头菌丝体培养物，再经成分提取制成猴头菇片、胃乐宁等。20世纪80年代起，真菌药物进入“固体发酵”时期。如将槐耳菌种接种在含一定水分的由农副产品（玉米芯、麦麸）组成并经过灭菌处理的瓶装固态基料上，在一定温度下槐耳菌摄取所需要的营养，将会生长大量含有活性成分的槐耳菌丝体。
随着科学技术的进步，高新技术给菌物药的研究和生产带来了创新性和革命性的发展，提高了菌物药的技术含量和品质。目前，高新技术在菌物的育种栽培及菌物药提取上取得了一定的成就。菌种是菌物药生产的关键因素，优良的菌种是保证产业稳步、健康发展的重要基础。在育种栽培方面，通过原生质体融合技术、基因工程、生长模拟技术、虚拟栽培技术等手段选育和培育了高品质的菌物。在提取方面，药用真菌由于其功效成分存在于真菌细胞内，需要通过一定的手段破坏其细胞壁，使其功效成分充分分散于提取体系。研究者通过酶解水浸提技术、超滤浓缩醇沉技术、半仿生提取技术、分子印迹技术等手段获取了高质量、高活性的菌物药。
